Таймаут запроса к бакету был 60с при бюджете таска 1500с — один
залипший GET отъедал почти весь прогон. Плюс map() отдаёт результаты
строго по порядку отправки, поэтому один медленный запрос блокировал
все 11 уже готовых потоков.
Таймаут снижен до 12с (обычный GET укладывается в доли секунды, 12с —
запас на джиттер), map() заменён на as_completed: готовые результаты
отдаются сразу, не дожидаясь залипшего соседа.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Молчащий heartbeat сторож трактовал как смерть прогона и снимал его по
порогу 10 минут. Но запись большой пачки отпечатков в базу на HDD идёт
COPY'ем 6-15 минут без единого тика heartbeat — и сторож убивал вполне
живой прогон, тут же запуская дубль по тем же статьям. Корпус часами
топтался на месте: из лога видно десятки перезапусков подряд с нулевым
приростом.
Теперь перед снятием сторож спрашивает воркеров queue.index через
inspect().active(), выполняется ли ещё таск прогона. Снимаются только
настоящие зомби — те, чьего celery_task_id нет ни на одном воркере.
Если хоть один воркер не ответил, живость не проверить и не снимается
ничего (fail-safe). Проверено на живом прогоне: его таск попал в набор
активных, прогон помечен защищённым.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Заливка Википедии останавливалась сама собой: позиция хранилась как номер
статьи, и каждый прогон перечитывал дамп с начала. На 20 тысячах это стоило
6 минут из 25 доступных, на 27 тысячах — уже около десяти, а на сотне тысяч
съело бы весь бюджет и заливка встала бы совсем. Ровно это и наблюдалось:
прогон висел с нулём полученных статей, воркер на 100% CPU.
Переход на multistream-вариант дампа: он состоит из независимых bz2-блоков по
~95 статей, к нему прилагается индекс со смещениями. Позиция продолжения стала
байтовым смещением, прогон стартует мгновенно с нужного места.
Проверено на реальных файлах, а не по предположению: формат индекса
(offset:page_id:title), 21 уникальное смещение на 2001 статью, прыжок seek на
смещение из середины файла даёт валидный XML со страницами.
wikipedia_resume_offset.py — разовый пересчёт позиции при переходе: находит по
индексу блок с максимальным залитым page_id (получилось 273 281 821).
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Массовый источник за прогон берёт порцию, сохраняет позицию и останавливается
по бюджету времени. Без внешнего толчка заливка шла рывками — ровно столько,
сколько раз кто-то нажмёт «Запустить», и всё это время корпус стоял на месте.
keep_ingesting.py раз в 5 минут проверяет, не простаивают ли массовые
источники, и запускает следующую порцию. Идущие прогоны не трогает.
Останавливается сам, когда источник исчерпан (прогон закрылся с нулём
полученных статей), чтобы не крутить пустые запуски вечно.
Поставлен в cron на app-хосте рядом с монитором.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Первый прогон нового конвейера показал слабое место: листинг бакета шёл с
начала, и заливка часами перемалывала уже существующие статьи как дубли —
из 300 полученных 300 оказались дублями.
S3 умеет start-after, и стартовый ключ выводится прямо из базы: ext_id вида
`pmc:PMC10000000` соответствует ключу `PMC10000000.1`, бакет отдаётся
лексикографически. Теперь при отсутствии сохранённого токена (первый прогон
после ручных заливок) листинг начинается после максимального залитого.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
О качестве проверки мы до сих пор знали только «механизм жив»: находит
подброшенный фрагмент. Продукт при этом продаёт процент заимствований, за
который никто не ручался — неизвестно было ни сколько списываний система
пропускает, ни как часто обвиняет невиновных.
Бенчмарк делает из документов корпуса «студенческие работы» четырёх видов и
гоняет их через настоящий путь L1. Первый замер на проде:
дословно 100% найдено
лёгкий рерайт 100% найдено
сильный рерайт 0% — это работа L3/L4, не L1
оригинал 0% ложных обвинений
То есть основа работает как задумано. Показательно другое: из 20 взятых
документов в замер попали 8 — у остальных нет полного текста нужной длины.
Узкое место не алгоритм, а глубина корпуса.
Запускать после изменения порогов и параметров winnowing — иначе непонятно,
улучшение сделано или ухудшение.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Монитор лежал только на сервере, не версионировался и месяц проверял
конфигурацию, которой уже нет: Ollama на CT 108 (.20.163), остановленном
27.08 при переходе на OpenRouter. Итог — вечный ложный DOWN, на фоне которого
теряются настоящие аварии, и полная слепота к реальному серверу эмбеддингов
(.1.40) и к воркерам.
- скрипт переехал в репозиторий и теперь деплоится вместе с кодом;
- адреса читаются из прод-.env, а не зашиты: сервер эмбеддингов переезжал
дважды, и каждый раз монитор оставался со старым адресом;
- добавлена проверка воркеров Celery — 05.09 брокер лежал час, воркеры молчали,
а монитор рапортовал, что всё хорошо, потому что смотрел только TCP-порт;
- разбор URL чинит падение на кредах в REDIS_URL/RABBITMQ_URL.
Проверено на проде: все восемь проверок отдают OK, включая Embeddings и
CeleryWorkers.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Заливку Википедии и PMC я сделал отдельными скриптами мимо существующей
инфраструктуры: запуск руками через ssh, состояние в файле в /tmp, никакой
видимости. Результат предсказуем — за неделю обе умерли молча (обрыв базы на
20 008 статьях из 2 млн и таймаут сети на 85 тыс. из 100 тыс.), прогресс
потерялся, а узнали мы об этом через неделю. При том что рядом лежит готовый
механизм: parse_sources, прогоны со шкалой, журнал, кнопки, ретраи Celery.
Теперь это обычные типы источника — wikipedia_ru и pmc_bulk:
- заводятся и запускаются из админки, как OpenAlex или КиберЛенинка;
- показывают ту же шкалу, журнал и кнопку остановки;
- падение воркера больше не теряет прогресс: позиция продолжения хранится в
parse_sources.resume_token (номер статьи в дампе / токен страницы бакета),
повторный запуск берёт следующую порцию;
- укладываются в бюджет времени таска — заливка идёт порциями, а не одним
многосуточным процессом.
Чего не хватало конвейеру для миллионов и что добавлено:
- парсеры отдают генератор, а не список: 2 млн статей в память не влезают;
- app/bulk_writer.py — запись пачками через COPY (21 тыс. строк/с против
6.7 тыс. построчно) с переподключением к базе при обрыве;
- эмбеддинги при массовой заливке не диспатчатся: они на порядок медленнее и
стали бы узким местом, вектора досчитываются отдельно (reembed_missing.py).
scripts/ops/bulk_ingest_*.py удалены — их работу делает конвейер.
Проверено на проде: оба парсера отдают документы, прогон через run_parser
завершается штатно, позиция продолжения сдвигается (300 → 600), повторный
запуск продолжает с неё.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
За неделю обе массовые заливки умерли молча и не возобновились: Википедия на
20 008 статьях из ~2 млн («server closed the connection»), PMC примерно на
85 тыс. из 100 тыс. (таймаут SSL-рукопожатия). Ни ретраев, ни возобновления.
- запись пачки повторяется с переподключением к базе (5 попыток с паузой);
- обрыв листинга бакета стоит паузы, а не всей заливки;
- у Википедии сохраняется позиция в дампе — после сбоя продолжаем с неё,
а не проматываем с нуля, полагаясь на дедуп по ext_id;
- батч уменьшен (500 статей × 2000 отпечатков = миллион строк в одной
транзакции — вероятная причина обрыва);
- обрезка отпечатков переведена на равномерную выборку.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Wikimedia закрывает долгие потоковые соединения: обрыв пришёлся на 32 МБ из
5.9 ГБ. Скачать файл с докачкой (curl -C -) и читать локально надёжнее, поэтому
у скрипта появился --dump-file; чтение из сети осталось запасным путём.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
У корпуса катастрофически мало пригодного русского текста: 99 883 документа
КиберЛенинки лежат со средней глубиной 30 отпечатков, то есть заголовок с
аннотацией. Проверил все русскоязычные источники, о которых имело смысл думать:
- Википедия ru — работает: дамп 5.6 ГБ читается потоком (на app-хосте всего
22 ГБ свободно, поэтому без сохранения на диск), ~919 отпечатков на статью.
Wikimedia отдаёт 403 без осмысленного User-Agent — учтено;
- КиберЛенинка — блокирует выкачку после ~130 запросов (замер 28.08);
- OpenAlex language:ru + OA — заявлено 395 410 работ, но по прямым pdf_url
скачалось 2 из 10, остальное 403 издателей; метка языка ненадёжна — в выдаче
англоязычные журналы. Массово не годится;
- eLIBRARY.RU — только по договору, Math-Net.Ru — 403 на архиве.
Википедия формально не научный источник, но студенты копируют из неё чаще, чем
из статей, а по объёму связного русского текста альтернатив среди доступного нет.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Прод переключён на новый сервер эмбеддингов (VM 210 «embedding-cpu»,
192.168.1.40, хост pve2). Ключевое, чего не было в исходном плане переключения:
OLLAMA_URL живёт в Infisical, и deploy.sh генерирует .env из него на каждом
запуске — правка .env на сервере откатилась бы первым же деплоем.
Совместимость векторов проверена прямым сравнением, а не на слово: косинус
0.9999997, расхождение 1e-4 (округление AVX2 против AVX-512) — переиндексация
93 тыс. векторов не понадобилась.
Документация приведена в соответствие с фактами:
- ARCHITECTURE/DIAGRAM/README/CREDENTIALS: новый сервер, старый помечен как
выведенный; убрано упоминание CUDA — GPU в проекте нет;
- DR-HA: эмбеддинги больше не висят на хосте .254, чьё падение 28.08 разом
унесло брокер, прокси и секреты;
- INGESTION: исправлено собственное враньё про КиберЛенинку — «48 часов на
100 тысяч» опровергнуто практикой, сайт блокирует выкачку после ~130 статей;
снапшот OpenAlex вычеркнут как путь к миллионам (там только метаданные).
bulk_ingest_pmc.py: снята пометка «не закончен» — бага не было, первый прогон
упал уже после успешной вставки, а второй корректно пропустил дубли. Проверено:
100 статей, 183 090 отпечатков. Реальный темп 0.3 ст/с записан честно.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Разведка под задачу «нужны миллионы»: постраничные API дают 1-2 статьи в
секунду и упираются в rate limit, а OpenAlex-дамп содержит только метаданные —
миллионы аннотаций бесполезны, что уже доказано на КиберЛенинке (30 отпечатков
на документ, 0 глубоко проиндексированных).
Найден и проверен рабочий источник: AWS Open Data бакет pmc-oa-opendata открыт
без ключа, у каждой статьи лежит готовый извлечённый текст (33-130 КБ) и json с
метаданными. Замер: 12 статей/с в 10 потоков — миллион за сутки.
Замеры узких мест на проде (для планирования масштаба):
- winnowing 95 док/с на ядро — не ограничение;
- поиск L1 31 мс по 500 отпечаткам при 113 млн строк;
- вставка отпечатков построчно 6.7 тыс. строк/с → миллион статей это 2.5 млрд
строк и четверо суток только на запись, поэтому в скрипте COPY;
- объём: 106 байт на строку → ~400 ГБ на миллион статей с индексами.
Скрипт НЕ закончен: документы вставляются верно, но шаг отпечатков ошибочно
пропускает свежие документы (пробные 200 записей удалены из базы). Ограничение
задокументировано прямо в скрипте, чтобы его не запустили на объёме.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Проверка глубины вскрыла главную слабость корпуса: 99 883 документа
КиберЛенинки (56% базы) имеют в среднем 30 отпечатков — заголовок с
аннотацией. Списывание из тела русской статьи L1 не находит, хотя сервис
рассчитан именно на русских студентов. У PMC и arXiv глубина 97% и 94%.
Отдельно: мерить глубину по minio_key оказалось неверно — PMC кладёт тело
статьи в отпечатки при заливке, не сохраняя файл, поэтому «27.5% с полным
текстом» занижало картину для одних источников и скрывало провал у другой.
Честный показатель — число отпечатков на документ, по нему всё и пересчитано.
- backfill_cyberleninka_pdf.py: PDF берётся прямым адресом {url}/pdf (докачка
по обычному url бесполезна — там HTML, замер 0 из 8). Проверено на 50:
углублено 44, в среднем 23 тыс. символов, глубина 30 → 1453 отпечатка;
- backfill_pmc_fulltext.py: сохранение тела статьи из API в MinIO (отпечатки
там уже глубокие — скрипт нужен для отчётов и подсветки, не для детекции);
- store_full_text вынесен из index.enrich_full_text: один путь «текст получен →
MinIO + пересчёт L1 + обновление L2» для задачи докачки и для бэкфиллов.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Проверка на живых данных вскрыла, что панель отладки врала в мою же пользу:
показывала 154 046 «документов с эмбеддингом» (87%), тогда как в FAISS реально
93 053 вектора (52.5%). Колонка documents.faiss_id для этого непригодна —
отметка остаётся после пересоздания индекса (смена модели: 768 → 1024) и после
сбоев worker-gpu. Выборочная проверка: у 8 из 20 «отмеченных» вектора нет.
- gpu.index_stats — новая задача, отдаёт реальное содержимое активного
векторного бэкенда; API спрашивает её для панели отладки;
- панель показывает «векторов в индексе» и отдельно предупреждает о ложных
отметках (их 60 993), потому что такие документы молча выпадают из L3:
в индексе их нет, а на пересчёт они не попадут — reembed ищет faiss_id IS NULL;
- scripts/ops/faiss_reconcile.py — сверяет отметки с индексом и обнуляет ложные,
после чего reembed_missing.py отправляет их на пересчёт. Проверен вживую
(dry-run на проде: 93 053 в индексе, 60 993 ложных отметок).
Документация: зафиксирована реальная глубина корпуса — полный текст только у
27.5% документов, у 79% меньше 500 отпечатков (уровень аннотации). Система
ловит списывание из того, что есть целиком; это граница, а не поломка.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Разбор итогов массовой заливки показал в отладке «среднюю длительность прогона»
в 2.8 часа там, где парсинг занимал 50 секунд: started_at пишется в момент
постановки в очередь, а очередь из 173 источников разбирается часами. Теперь
момент реального старта пишется отдельно (run_started_at, миграция 006), а
схема отдаёт обе величины — сколько ждал очереди и сколько работал.
Плюс scripts/ops/reembed_missing.py: документ попадает в корпус сразу, а вектор
для L3 считает отдельная задача; когда worker-gpu или Ollama недоступны, эти
задачи теряются и документ остаётся невидимым для семантического поиска. Скрипт
находит faiss_id IS NULL и переотправляет пачками (dry-run по умолчанию) —
сейчас таких 23 101 из 177 147.
Документация: актуальные цифры корпуса, дубли при повторном прогоне, лимит
OpenAlex, и главное — гипервизор .254 зафиксирован в DR-HA как самая широкая
единая точка отказа (брокер, эмбеддинги, секреты и прокси на одном железе;
подтверждено аварией 28.08).
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Массовый запуск показал: лимит вежливого пула OpenAlex (10 req/s) общий на
mailto, а не на процесс. Четыре воркера с паузой 0.1с получали сплошные 429,
и каждый прогон уходил в 900с бесполезного backoff, не забрав ничего.
- RATE_LIMIT_DELAY 0.1 → 1.0с (≈4 req/s на четырёх воркерах);
- backoff спит кусками по 5с и отчитывается через progress_cb: прогон больше
не выглядит зависшим в админке и отменяется во время ожидания, а не после.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Заливка корпуса была чёрным ящиком: у источника только last_status
(idle/running/done/error), без «сколько из скольки», без причины падения и без
способа остановить начатое. Теперь каждый запуск создаёт строку parse_runs,
куда воркер раз в ~2с пишет стадию, счётчики и журнал событий.
Админка:
- шкала загрузки у каждого источника (0→50% выборка, 50→100% индексация),
раскрытая строка — журнал прогона по шагам с таймингами;
- «Запустить всё» / «Остановить всё» и остановка по одному источнику
(кооперативная отмена: воркер останавливается сам, не рвя запись в базу);
- пакетное добавление источников (тип + список тем), тип pmc в форме;
- загрузка PDF/DOCX/TXT прямо в базу сравнения (index.ingest_upload);
- страница «Отладка»: воркеры Celery и их текущие таски, очереди RabbitMQ,
покрытие корпуса эмбеддингами, зависшие и упавшие прогоны, конфиг бэкендов.
Защита от краш-лупа по consumer_timeout RabbitMQ (docs/DR-HA.md §6), без неё
массовый запуск 170+ источников гарантированно ронял воркер:
- PARSER_TIME_BUDGET_S (1500с) — прогон закругляется сам и помечается partial;
- worker_prefetch_multiplier=1 — таймаут считается от ДОСТАВКИ сообщения, и с
дефолтным префетчем очередь долгих run_parser убивала канал на задачах,
которые ещё не начинались.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
deploy.sh теперь на каждом запуске логинится в Infisical (Machine Identity
Universal Auth) и генерирует .env из окружения prod перед синком кода и
поднятием контейнеров. Если Infisical недоступен или вернул подозрительно
мало ключей — деплой падает раньше, не трогая рабочий .env на сервере.
Добавлен шаг compose up -d без --build для всех бэкенд-сервисов после
сборки изменившихся — иначе правка секрета без изменения кода не попадала
бы в уже запущенные контейнеры (docker compose пересоздаёт только то, чей
эффективный конфиг реально изменился, остальное не трогает).
5 попыток (1860с суммарно) были чуть больше дефолтного consumer_timeout
RabbitMQ (1800с) — брокер рвал канал раньше, чем таск успевал сдаться и
подтвердиться, воркер падал, docker его перезапускал, сообщение
редоставлялось и весь цикл забега начинался заново с попытки 1 —
бесконечный краш-луп, блокирующий весь пул воркера (concurrency=4).
Было: на 429 плоское ожидание 60с и retry без счётчика — при нескольких
параллельных источниках (4 воркера) каждый продлевал общий rate limit
сам, получался самоподдерживающийся затык без единого успешного запроса
по 20+ минут. Теперь: до 5 попыток с экспоненциальным backoff
(60/120/240/480/960с), после — источник сдаётся с тем, что успел
собрать, вместо вечного retry.
Исходный список из 29 дисциплин был чисто вузовски-научным (экономика,
право, психология и т.д.) — ни одной темы уровня СПО/колледжей
(полиграфия, строительство, сварка, туризм и т.п.), хотя реальные
дипломы студентов именно на них. +29 новых дисциплин, идемпотентно
(старые 30 не трогает).
Реализовано без authlib, на голом httpx (AsyncClient — синхронный httpx
блокировал бы event loop API на время внешнего запроса), по образцу двух
провайдеров:
- Миграция 004: hashed_password → nullable (OAuth-юзеры без пароля),
oauth_provider/oauth_id + уникальный индекс на пару.
- app/core/security.py: verify_password защищён от hashed=None (иначе TypeError
при попытке OAuth-юзера войти по паролю — нашёл при ревью, не баг-репорт).
- app/core/oauth.py: get_authorize_url()/exchange_code() — единый интерфейс для
google/yandex. Redirect URI: <APP_URL>/api/auth/<provider>/callback.
- app/api/auth.py: GET /auth/{provider}/login (редирект на согласие, state в
httponly-cookie от CSRF) и /callback (обмен code, find-or-create юзера по
oauth_id → по email для привязки существующего аккаунта → новый без пароля,
is_verified=email_verified от провайдера). Токен фронту — через URL-фрагмент
#token=..., не query (не уходит в логи/Referer).
- Фронтенд: OAuthButtons (Login/Register), страница /oauth/callback (читает
фрагмент → GET /auth/me → setAuth → редирект в кабинет).
- 6 юнит-тестов чистой логики сборки ссылок (app/core/oauth.py) — первый тест-
контур для api/ в этой сессии (pytest.ini/conftest/requirements-test по
образцу остальных сервисов), добавлен в общий run_tests.sh + mypy-гейт.
GOOGLE_CLIENT_ID/SECRET уже в .env (юзер создал OAuth-клиент), YANDEX_* пусты —
эндпоинты в этом случае отвечают 503, не падают. .env.example документирует обе
пары. Тестов всего: 118 (было 112).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Ответ на "неужели больше нет" / "мы ведь можем это исправить": закрывает
две дыры относительно Антиплагиат.ру/Turnitin, о которых договорились.
1. Различение цитаты и голого плагиата (app.scoring.is_cited, worker-gpu):
эвристика — фрагмент считается процитированным, если обрамлён кавычками
(«…», "…") либо сразу за ним (в пределах ~150 симв.) идёт скобочная ссылка
с годом: [Иванов, 2023], (Smith, 2020) — совпадает и с нашим же форматом
ГОСТ 7.0.5. aggregate_results теперь принимает full_text, размечает
match["cited"] и считает uncited_similarity (доля БЕЗ похожих на цитаты —
ближе к тому, что коммерческие системы называют "% некорректных
заимствований") отдельно от overall_similarity (как было, для совместимости).
Фронтенд: бейдж "Цитата" на совпадении + строка с разбивкой в отчёте
(аддитивные опциональные поля в типах — старые задачи не ломаются).
2. Автопополнение корпуса проверенными работами (как у коммерческих систем —
так ловится списывание у предыдущих потоков). Раньше загруженная на проверку
работа складывалась в StagedWork и ждала РУЧНОГО одобрения админом — де-факто
не пополняла базу для сравнения. Теперь index.auto_approve_submission
(диспатчится из gpu.check_plagiarism ПОСЛЕ сохранения результата — чтобы
работа не сматчилась сама с собой) добавляет её в documents автоматически,
под настройкой AUTO_APPROVE_SUBMISSIONS (default True). Ручное
approve/reject в админке остаётся рабочим (идемпотентно — auto-approve
пропускает уже не-pending записи), пригодится при AUTO_APPROVE=False.
Конвертация StagedWork→doc_data вынесена в чистый app/staging.py (без
Celery/SQLAlchemy/MinIO) — тестируется изолированно, идентична ручному
пути в admin.py (POST /admin/staging/{id}/approve).
Тестов добавлено 16 (scoring 8→18, новый staging.py — 6). Оба mypy-гейта
расширены (scoring.py, staging.py). Тестов всего: 112 (было 82 в последнем
подсчёте README — таблица давно отставала, заодно поправил на актуальные цифры
по всем сервисам, включая забытый в прошлый раз Qdrant).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Оставался незакоммиченным с предыдущего шага (докачка full-text). Переспрашивает
59 уже засеянных cyberleninka-тем из parse_sources, матчит raw-статьи с уже
залитыми documents по ext_id, и там где minio_key ещё не проставлен — пересчитывает
Winnowing-отпечатки из OCR full_text (не короткой annotation) и сохраняет текст в
MinIO. Идемпотентно (пропускает уже обработанные). Не трогает faiss_id/эмбеддинги.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Отвечает на "неужели больше нет библиотек" — добавлен четвёртый источник.
PMC Open Access Subset (NCBI E-utilities) — крупнейший биомедицинский открытый
архив, бесплатный API без обязательного ключа (NCBI_API_KEY — опционально,
поднимает лимит 3→10 запросов/сек). В отличие от остальных источников отдаёт
РЕАЛЬНЫЙ полный текст статьи (bodyJATS XML) прямо в ответе efetch — 17-53К
символов на статью в проверке вживую, не аннотацию и не 700-символьный OCR-
фрагмент. Никаких новых зависимостей — xml.etree.ElementTree (stdlib) + httpx,
по образцу arxiv.py.
- scripts/parsers/pmc.py: esearch (open access[filter]) → efetch (батчи по 20,
JATS XML) → плоские словари → unified schema. Год-фильтр, свой User-Agent.
- Зарегистрирован в index.run_parser (services/worker-indexer/app/tasks/index.py)
и в CLI run_parser.py — доступен как source_type="pmc" наравне с остальными.
- 7 юнит-тестов на реальных JATS XML-фрагментах (без сети): извлечение полей,
фильтр contrib-type=author (не editor), пустой/битый XML, батч из 2 статей.
Рассмотрены и НЕ добавлены: Semantic Scholar (общий rate-limit исчерпан без
API-ключа, ключ — самостоятельная регистрация юзера) и CORE.ac.uk (обязателен
ключ). Google Scholar/ResearchGate — намеренно не трогаем, скрейпинг нарушает ToS.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Поисковый API КиберЛенинки отдаёт поле "ocr" — список OCR-фрагментов текста
статьи (начало + фрагмент с ключевыми словами), прямо в ответе search. Раньше
transform() игнорировал его (full_text всегда None), и Winnowing-отпечатки (L1)
считались только по короткой annotation (~150 симв.) либо не считались вовсе,
если аннотации не было.
Теперь ocr (список) склеивается, чистится (<b>/сущности) и идёт в full_text —
add_document уже умеет: `text = full_text or abstract`. Даёт заметно более точные
L1-отпечатки для ВСЕХ будущих CyberLeninka-документов бесплатно — 0 доп. HTTP-
запросов, работает и там, где annotation вообще пустая (проверено вживую).
2 новых теста (ocr→full_text, отсутствие ocr→None). Тестов в файле: 7.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Продолжение seed_ru_sources.py: все 30 базовых RU-тем + 26 EN-тем (OpenAlex) +
4 категории arXiv уже отработаны (done). Этот скрипт добавляет НОВОЕ поверх —
углубление RU (специализированные подотрасли права/экономики/IT, 29 тем) и
расширение EN на области, которых не было (право, лингвистика, история,
искусство, науки о Земле и т.д., 20 тем) + 15 новых тем arXiv. Идемпотентно
(префиксы ru2:/oa3:/arxiv2: не пересекаются с уже существующими).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Прод-воркер падал на index.run_parser с 'No module named bs4': парсер импортил
beautifulsoup4 на верхнем уровне, а в образе worker-indexer его нет. Но bs4 нужен
только для fetch_article_details (детали статьи), а заливке (fetch+transform) — нет.
- импорт bs4 сделан ленивым (внутри fetch_article_details) → заливка работает даже
без bs4 в образе;
- beautifulsoup4 добавлен в worker-indexer/requirements.txt (для деталей статьи).
Это была вторая причина, почему CyberLeninka никогда не наполняла базу (первая —
GET вместо POST, 405). Проверено вживую: fetch без bs4 в пути работает.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Корпус на 99.4% английский, 0 русских источников — при том что сервис для русских
студентов. Корень: парсер CyberLeninka был сломан (слал GET на /api/search → HTTP
405) и ни разу не наполнял базу.
- cyberleninka.py: GET→POST с JSON-телом (mode=articles); authors теперь из списка
(API отдаёт список, не строку); чистка <b>-подсветки и HTML-сущностей (").
Проверено вживую: 5/5 студенческих тем возвращают реальные русские статьи.
- Юнит-тесты парсера (scripts/parsers/tests/, 5 шт.) + обвязка; run_tests.sh обобщён
на пути → парсеры теперь в тест-гейте CI. Всего тестов: 87.
- scripts/seed_ru_sources.py: сидер parse_sources по 30 студенческим дисциплинам
(dry-run по умолчанию, --apply для записи). НЕ запускает заливку — готовит задания.
- docs/INGESTION.md: runbook (текущее состояние, шаги запуска, проверка, масштаб).
Прод-путь index.run_parser уже поддерживает cyberleninka и openalex(lang=ru).
Заливку не запускал — это отдельный go (ресурсоёмко: GPU-эмбеддинги, рост БД).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Закрыта слепая зона «бэкапы есть, но восстановление не проверялось».
- scripts/ops/pg_restore_verify.sh — берёт последний дамп из MinIO backups/pg/,
restore в ЭФЕМЕРНЫЙ postgres:16, проверяет ключевые таблицы (users/documents/
tasks). Прод не трогает, всё в одноразовом контейнере. Под cron раз в неделю.
- docs/DR-HA.md — runbook: бэкапы, проверка восстановления, потоковая репликация
PG, Redis-реплика+Sentinel, таблица SPOF со статусом митигаций.
Провижн реплик PG/Redis — на Proxmox (нужен новый LXC), это работа на железе, не
в репозитории; runbook даёт конкретные шаги. Векторный SPOF уже снимается Qdrant.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Сортировка (кириллица→латиница), нумерация и выбор форматтера жили внутри
Celery-задачи с БД и не тестировались — хотя это порядок и вид готового списка
литературы, который видит студент. Вынес в чистый app.bibliography.build_bibliography:
- нумерация сквозная с 1; total = число записей;
- сортировка по фамилии первого автора, кириллица раньше латиницы;
- стиль 7.1 → полное описание (format_full), иначе 7.0.5 → краткая ссылка;
- doc_id сохраняется в каждой записи; пустой список → total 0.
ORM→dict конверсия осталась в задаче (она из БД), поведение сохранено 1:1.
Добавлен в mypy-гейт. Тестов всего: 73 (indexer 24, gost 24, gpu 25).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
_split_into_fragments жила в тяжёлой Celery-задаче (celery/sqlalchemy/minio) и
не тестировалась, хотя именно она определяет, ЧТО проверяется на плагиат.
Вынес в чистый app.fragments.split_into_fragments — тестируется изолированно:
- пустой/пробельный текст → [];
- текст короче 20 слов → отбрасывается порогом длины;
- короткий текст → один фрагмент на весь объём, start=0;
- скользящее окно: перекрытие ровно (window-step) слов, хвост==голова соседа;
- start/end — корректные символьные офсеты в исходный текст.
Поведение сохранено 1:1. Добавлен в mypy-гейт. Тестов всего: 66.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Итоговый процент схожести (тот, что видит студент) и дедупликация совпадений
жили внутри Celery-задачи check_plagiarism и не тестировались. Вынес в чистую
функцию app.scoring.aggregate_results (без Celery/БД/сети) — правильная «высота»
(доменная логика отдельно от оркестрации) и теперь покрыто тестами:
- процент = доля УНИКАЛЬНЫХ помеченных позиций от всех фрагментов;
- одна позиция с несколькими источниками считается один раз (не раздувает %);
- точный дубль (source_title:pos) дедуплицируется;
- деление на ноль фрагментов; кап на 100%; округление до 2 знаков; by_method.
Поведение сохранено 1:1 (лог задачи переведён на result[...]). scoring.py добавлен
в mypy-гейт. Тестов всего: 61 (indexer 19, gost 17, gpu 25).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Ruff уже стоял; теперь рядом mypy как проверка типов. Прагматичный конфиг
mypy.ini (ловит реальные несовпадения типов/обращения к None/неверные аргументы,
но не требует аннотаций везде и не шумит на сторонних либах) — чтобы гейт был
зелёным и расширяемым.
Область на старте — только чистая логика, которая уже типобезопасна:
worker-indexer/app/algorithms (L1 winnowing, L2 minhash) и
worker-gost/app/formatters (ГОСТ 7.1 / 7.0.5). Запуск per-service, чтобы
резолвился локальный пакет app. faiss_manager вне области пока — требует
Optional-рефактора _index; на следующий заход.
run_lint.sh теперь гоняет ruff + mypy в одном контейнере; шаг CI переименован.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Второй CI-гейт после тестов: ruff как статический анализатор всего Python-кода
(services + scripts). Раньше ни линта, ни проверки типов в CI не было вовсе.
Конфиг ruff.toml: правила E/F/W/I/UP/B/SIM/C4, line-length 100. Осознанно
выключены E501 (длину держит форматтер; длинные RU-комментарии — норма),
B008 (Depends()/Query() в дефолтах — идиома FastAPI, не баг) и UP042
((str, Enum)→StrEnum меняет __str__/сериализацию — не трогаем).
Починено под ноль находок:
- B904 (11): raise ... from exc / from None — читаемые цепочки исключений в
Celery-ретраях и HTTPException, ошибки обработки не маскируют исходные.
- SIM105 (5): try/except/pass → contextlib.suppress (faiss remove_ids, lsh.remove,
сброс кэша, ws-disconnect, парс года).
- C416/SIM108/B905/F841/UP035/UP017/F401/I001: dict(rows), тернарник, zip strict,
мёртвая переменная, устаревшие импорты, timezone.utc→UTC, чистка/сортировка.
Обвязка: scripts/run_lint.sh (ruff в изолированном python:3.11-slim), шаг «Линт»
в job test перед юнит-тестами (падаем раньше). make lint / make lint-fix.
Все 41 юнит-тест по-прежнему зелёные, изменённые файлы компилируются.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Первый настоящий автоматический тест-суит проекта — раньше регрессии ловились
руками. Покрыта чистая логика детекции и форматирования (без БД/Redis/GPU/Ollama):
- worker-indexer: L1 Winnowing (точные совпадения, идемпотентность отпечатка,
диапазон signed int64) и L2 MinHash LSH (шинглы, Jaccard, near-duplicate +
upsert через in-memory-фолбэк).
- worker-gpu: L3 FAISS — возврат doc_id из PostgreSQL (IndexIDMap2),
идемпотентность add_vectors (remove-before-add, без дублей), self-match ≈ 1,
ранжирование. Прямо стережёт баги, из-за которых индекс переписывался.
- worker-gost: ГОСТ 7.1-2003 и 7.0.5-2008 — авторы (≤3 / 4+ «и др.»/et al.),
статья/книга/web, DOI, порядок сортировки кириллица→латиница, стр. в ссылке.
Обвязка: per-service pytest.ini/conftest/requirements-test. scripts/run_tests.sh
гоняет тесты в изолированных python:3.11-slim контейнерах (не засоряя хост),
через Tsinghua-зеркало. CI: job `test` теперь гейтит `deploy` (needs: test) —
падение тестов блокирует прод-деплой. make test / make test-one SVC=...
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Корпус набивался с ~8% полного текста — по широким темам мало доступных PDF.
- OpenAlex: параметр open_access_only (is_oa:true), включён по умолчанию для
заливки (INGEST_OPEN_ACCESS_ONLY). A/B: покрытие 20% → 45%.
- arXiv: url теперь прямая ссылка на PDF (был на HTML-страницу аннотации),
теперь enrich_full_text реально качает текст (у arXiv PDF почти у 100%).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Первый прогон вслепую пересобирал все 5 бэкенд-образов, включая worker-gpu
(torch/faiss ~2 ГБ) — на медленном канале это ~1-2 часа впустую, хотя коммит
менял только CI-файлы. Теперь deploy.sh по git-diff с прошлого деплоя
(маркер .last_deploy_sha) собирает лишь сервисы с изменённым кодом; фронт
пересобирается только при правках services/frontend; правка compose = полная
пересборка. Workflow клонирует репозиторий полностью (нужен лог для diff).
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Self-hosted act_runner в host-режиме на app-хосте 1.32 (label "deploy").
При пуше в main workflow клонирует коммит и запускает scripts/deploy.sh:
синхронизация кода → пересборка/перезапуск бэкенд-сервисов → миграции →
сборка фронтенда → выкладка статики на CT 102 (reverse-proxy) с бэкапом.
Доступ к Proxmox-хосту для CT 102 — через секрет PVE_PASSWORD.
Больше ручных rsync/rebuild — деплой по git push.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
Раньше корпус состоял только из метаданных: парсеры отдают full_text=None,
fingerprints/эмбеддинги считались из аннотаций, MinIO статьями не наполнялся
вовсе. Проверка плагиата шла против абстрактов, а не тел статей.
Добавлено:
- app/fulltext.py: best-effort скачивание PDF по url источника (стрим с
лимитом размера, детект PDF по content-type/magic), извлечение текста
через PyMuPDF.
- index.enrich_full_text: новая задача — качает полный текст, кладёт в MinIO
(documents/corpus/{id}.txt), пересчитывает fingerprints по полному тексту,
обновляет MinHash. Диспатчится из add_document при FETCH_FULL_TEXT=true.
- openalex: предпочитаем прямую ссылку на PDF (best_oa_location.pdf_url)
вместо лендинга — покрытие full-text выросло с 17% до 33% на выборке.
- run_parser батчит эмбеддинги (EMBED_BATCH_SIZE) вместо диспатча по одному
документу: worker-gpu кодирует пачку разом и реже переписывает FAISS-индекс.
Покрытие ~33% (прямые OA-PDF: arxiv/usenix/springer/techscience и т.п.);
для остального остаётся фолбэк на аннотацию. Управляется FETCH_FULL_TEXT.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>
