За неделю обе массовые заливки умерли молча и не возобновились: Википедия на
20 008 статьях из ~2 млн («server closed the connection»), PMC примерно на
85 тыс. из 100 тыс. (таймаут SSL-рукопожатия). Ни ретраев, ни возобновления.
- запись пачки повторяется с переподключением к базе (5 попыток с паузой);
- обрыв листинга бакета стоит паузы, а не всей заливки;
- у Википедии сохраняется позиция в дампе — после сбоя продолжаем с неё,
а не проматываем с нуля, полагаясь на дедуп по ext_id;
- батч уменьшен (500 статей × 2000 отпечатков = миллион строк в одной
транзакции — вероятная причина обрыва);
- обрезка отпечатков переведена на равномерную выборку.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Прод переключён на новый сервер эмбеддингов (VM 210 «embedding-cpu»,
192.168.1.40, хост pve2). Ключевое, чего не было в исходном плане переключения:
OLLAMA_URL живёт в Infisical, и deploy.sh генерирует .env из него на каждом
запуске — правка .env на сервере откатилась бы первым же деплоем.
Совместимость векторов проверена прямым сравнением, а не на слово: косинус
0.9999997, расхождение 1e-4 (округление AVX2 против AVX-512) — переиндексация
93 тыс. векторов не понадобилась.
Документация приведена в соответствие с фактами:
- ARCHITECTURE/DIAGRAM/README/CREDENTIALS: новый сервер, старый помечен как
выведенный; убрано упоминание CUDA — GPU в проекте нет;
- DR-HA: эмбеддинги больше не висят на хосте .254, чьё падение 28.08 разом
унесло брокер, прокси и секреты;
- INGESTION: исправлено собственное враньё про КиберЛенинку — «48 часов на
100 тысяч» опровергнуто практикой, сайт блокирует выкачку после ~130 статей;
снапшот OpenAlex вычеркнут как путь к миллионам (там только метаданные).
bulk_ingest_pmc.py: снята пометка «не закончен» — бага не было, первый прогон
упал уже после успешной вставки, а второй корректно пропустил дубли. Проверено:
100 статей, 183 090 отпечатков. Реальный темп 0.3 ст/с записан честно.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
Разведка под задачу «нужны миллионы»: постраничные API дают 1-2 статьи в
секунду и упираются в rate limit, а OpenAlex-дамп содержит только метаданные —
миллионы аннотаций бесполезны, что уже доказано на КиберЛенинке (30 отпечатков
на документ, 0 глубоко проиндексированных).
Найден и проверен рабочий источник: AWS Open Data бакет pmc-oa-opendata открыт
без ключа, у каждой статьи лежит готовый извлечённый текст (33-130 КБ) и json с
метаданными. Замер: 12 статей/с в 10 потоков — миллион за сутки.
Замеры узких мест на проде (для планирования масштаба):
- winnowing 95 док/с на ядро — не ограничение;
- поиск L1 31 мс по 500 отпечаткам при 113 млн строк;
- вставка отпечатков построчно 6.7 тыс. строк/с → миллион статей это 2.5 млрд
строк и четверо суток только на запись, поэтому в скрипте COPY;
- объём: 106 байт на строку → ~400 ГБ на миллион статей с индексами.
Скрипт НЕ закончен: документы вставляются верно, но шаг отпечатков ошибочно
пропускает свежие документы (пробные 200 записей удалены из базы). Ограничение
задокументировано прямо в скрипте, чтобы его не запустили на объёме.
Co-Authored-By: Claude Opus 5 <noreply@anthropic.com>
